Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMTNP53814 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMTNP53814 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMTNP53814 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMTNP53814 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMTNP53814 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMTNP53814 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMTNP53814 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMTNP53814 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMTNP53814 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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