Protein–RNA interactions for Protein: P43026

GDF5, Growth/differentiation factor 5, humanhuman

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF5P43026 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
GDF5P43026 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDF5P43026 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDF5P43026 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDF5P43026 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
GDF5P43026 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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GDF5P43026 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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GDF5P43026 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
GDF5P43026 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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GDF5P43026 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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GDF5P43026 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
GDF5P43026 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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