Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 USP6NL-201ENST00000277575 4512 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ARMC8-223ENST00000538260 4728 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 DCAF4L1-201ENST00000333141 4772 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 N6AMT1-202ENST00000351429 4781 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RPGR-203ENST00000378505 4767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SEMA4D-211ENST00000438547 4824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 KCNMB1-201ENST00000274629 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MAP1B-201ENST00000296755 12036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC068473.3-202ENST00000589723 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CNGB1-204ENST00000564448 4364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NFASC-207ENST00000404907 5447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ARMC9-214ENST00000611582 5759 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ZNF423-203ENST00000561648 7907 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 DOK6-201ENST00000382713 8890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TNP1P09430 BAZ2A-214ENST00000551812 8600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SMARCE1-202ENST00000348513 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ITGBL1-205ENST00000545560 4808 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AAK1-201ENST00000406297 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PNMA3-203ENST00000619635 3627 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 FBN2-201ENST00000262464 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NTNG1-206ENST00000370071 3149 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PGM1-202ENST00000371084 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MAGED4-201ENST00000375626 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 KLHL15-201ENST00000328046 6272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 NOBOX-201ENST00000467773 2076 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SCN1B-208ENST00000640135 4846 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 KRBA1-201ENST00000319551 4020 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TNP1P09430 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms