Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SCN2BO60939 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms