Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 MKRN2-203ENST00000448482 1679 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARID3CA6NKF2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 XRN1-203ENST00000463916 2075 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARID3CA6NKF2 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms