Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 COLQ-202ENST00000383786 1482 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AL390961.2-201ENST00000454991 472 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TRIM71Q2Q1W2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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