Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CGNL1Q0VF96 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms