Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC064836.1-201ENST00000405197 704 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL133517.1-201ENST00000413412 748 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC00618-201ENST00000435624 700 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 NME6-211ENST00000447314 621 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC104117.1-201ENST00000517817 900 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 FOLR1-203ENST00000393679 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TMEM254-213ENST00000613758 2154 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SRSF5-201ENST00000394366 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LIMS1-204ENST00000409441 1627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 HNRNPL-210ENST00000600873 1633 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SYCE1-201ENST00000303903 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TMIGD1-201ENST00000328886 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AL391987.4-201ENST00000377547 439 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 KRT41P-201ENST00000393988 1293 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AKR1C5P-201ENST00000427165 609 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 NR1I3-210ENST00000437437 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC010136.1-201ENST00000450996 568 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SRGAP3-AS2-203ENST00000600323 1294 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 C5orf60-208ENST00000625191 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 UBR1-212ENST00000627960 189 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 CHRNA1-208ENST00000636168 1862 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC074366.1-204ENST00000446277 552 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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PTPRMP28827 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC025538.1-201ENST00000510707 1486 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC124319.4-201ENST00000622931 2161 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 U3.49-201ENST00000391065 214 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 ARF1P2-201ENST00000392493 538 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 AC022483.2-201ENST00000461464 555 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PTPRMP28827 RBP5-202ENST00000542370 564 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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