Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PUF60Q9UHX1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PUF60Q9UHX1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PUF60Q9UHX1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms