Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CLIP2Q9UDT6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms