Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM8A1Q9UBU6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM8A1Q9UBU6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms