Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL13Q9P2N7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
KLHL13Q9P2N7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms