Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH9

SLTM, SAFB-like transcription modulator, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-217ENST00000509119 509 ntTSL 319.5■□□□□ 0.712e-6■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-203ENST00000457650 617 ntTSL 517.51■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-207ENST00000503284 560 ntTSL 416.86■□□□□ 0.292e-6■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-219ENST00000510763 543 ntTSL 416.83■□□□□ 0.282e-6■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 NDST1-206ENST00000522491 777 ntTSL 221.7■■□□□ 1.064e-7■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 CHD9-208ENST00000563410 488 ntTSL 221.65■■□□□ 1.064e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 NDST1-204ENST00000519157 576 ntTSL 520.62■□□□□ 0.894e-7■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 ARFGAP1-205ENST00000468975 2640 ntTSL 218.44■□□□□ 0.544e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 ARFGAP1-204ENST00000395285 2697 ntTSL 217.58■□□□□ 0.414e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.364e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.134e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.084e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -04e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 DNAAF5-206ENST00000461576 298 ntTSL 28.74□□□□□ -1.014e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 CHD9-217ENST00000565832 2169 ntTSL 1 (best)6.47□□□□□ -1.374e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.574e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.814e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.884e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.884e-10■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 TRIM56-203ENST00000467847 581 ntTSL 217.82■□□□□ 0.442e-7■■■■□ 20.7
SLTMQ9NWH9 AC140504.1-201ENST00000568766 498 ntAPPRIS P1 TSL 224.41■■□□□ 1.55e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-203ENST00000421929 979 ntTSL 1 (best)21.33■■□□□ 1.015e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.975e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-203ENST00000464525 2456 ntTSL 220.92■□□□□ 0.945e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.755e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.615e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-205ENST00000489144 2553 ntTSL 218.77■□□□□ 0.65e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 FMO5-205ENST00000527849 2410 ntTSL 518.29■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.434e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.45e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 AC140504.1-203ENST00000567442 476 ntTSL 217.36■□□□□ 0.375e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-218ENST00000513506 958 ntTSL 516.18■□□□□ 0.185e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-206ENST00000502415 769 ntTSL 516.13■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.154e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.075e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-204ENST00000486319 1532 ntTSL 1 (best)15.33■□□□□ 0.045e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 05e-7■■■■□ 20.6
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SLTMQ9NWH9 POLR2J3-216ENST00000511773 783 ntTSL 513.52□□□□□ -0.255e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-211ENST00000506060 793 ntTSL 312.59□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-210ENST00000504677 727 ntTSL 512.5□□□□□ -0.415e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-207ENST00000448782 975 ntTSL 1 (best)12.31□□□□□ -0.445e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-201ENST00000379340 1598 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 POLR2J3-213ENST00000508848 1030 ntTSL 511.06□□□□□ -0.645e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SLC23A2-203ENST00000423430 911 ntTSL 510.14□□□□□ -0.795e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SLC23A2-202ENST00000379333 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.85e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SPTLC3-204ENST00000450297 645 ntTSL 39.94□□□□□ -0.825e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.865e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.885e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 FMO5-202ENST00000369272 2168 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.014e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 FMO5-203ENST00000441068 1696 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.094e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SPTLC3-203ENST00000434210 572 ntTSL 37.62□□□□□ -1.195e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.225e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.265e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-208ENST00000449627 909 ntTSL 46.69□□□□□ -1.345e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-212ENST00000477534 930 ntTSL 1 (best)6.66□□□□□ -1.345e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.395e-7■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.72□□□□□ -1.494e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-210ENST00000506360 5829 ntTSL 218.56■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-206ENST00000502669 3484 ntTSL 1 (best)15.97■□□□□ 0.153e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-225ENST00000515682 4293 ntTSL 214.74□□□□□ -0.053e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■□ 20.6
SLTMQ9NWH9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.361e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 SH3BP2-208ENST00000504294 557 ntTSL 515.18■□□□□ 0.022e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.51■□□□□ 0.398e-10■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 RSRP1-211ENST00000564413 599 ntTSL 412.2□□□□□ -0.468e-10■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 DIDO1-204ENST00000370368 2704 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 DIDO1-205ENST00000370371 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.261e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 DIDO1-206ENST00000395340 7551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 429.41■■■□□ 2.32e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 220.74■□□□□ 0.912e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-214ENST00000569572 578 ntTSL 314.34□□□□□ -0.112e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.122e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 313.82□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.344e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 USP4-212ENST00000486549 749 ntTSL 515.32■□□□□ 0.044e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 USP4-204ENST00000416417 1536 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.54e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 USP4-202ENST00000351842 3222 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.894e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-210ENST00000464987 2205 ntTSL 520■□□□□ 0.795e-7■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-216ENST00000526055 469 ntTSL 219.15■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-213ENST00000524895 401 ntTSL 416.46■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-220ENST00000532375 518 ntTSL 514.48□□□□□ -0.095e-7■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.532e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 AL592295.4-201ENST00000636161 997 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 20.5
SLTMQ9NWH9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.345e-7■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 SPHK1-206ENST00000590379 588 ntTSL 321.82■■□□□ 1.082e-7■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.783e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.293e-6■■■■□ 20.4
SLTMQ9NWH9 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-6■■■■□ 20.4
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