Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TM7SF3Q9NS93 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM7SF3Q9NS93 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms