Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TALDO1-208ENST00000532685 568 ntTSL 227.59■■■□□ 2.016e-13■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.985e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-214ENST00000493590 625 ntTSL 527.18■■□□□ 1.945e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-222ENST00000582395 565 ntTSL 426.79■■□□□ 1.885e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TNK2-212ENST00000439230 2331 ntTSL 1 (best)26.7■■□□□ 1.865e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-229ENST00000583359 896 ntTSL 526.68■■□□□ 1.865e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-216ENST00000449311 681 ntTSL 526.43■■□□□ 1.828e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 BRF1-217ENST00000550375 1362 ntTSL 326.25■■□□□ 1.795e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-208ENST00000480994 732 ntTSL 526.13■■□□□ 1.775e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-207ENST00000577471 573 ntTSL 425.89■■□□□ 1.745e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-213ENST00000578064 548 ntTSL 425.89■■□□□ 1.745e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-225ENST00000582545 470 ntTSL 425.8■■□□□ 1.725e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-206ENST00000489616 583 ntTSL 225.69■■□□□ 1.75e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-208ENST00000498199 511 ntTSL 225.6■■□□□ 1.695e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-211ENST00000421589 824 ntTSL 225.28■■□□□ 1.648e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.635e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-213ENST00000520629 415 ntTSL 325.19■■□□□ 1.625e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.615e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.586e-13■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-215ENST00000584413 577 ntTSL 424.83■■□□□ 1.575e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 BRF1-220ENST00000552127 778 ntTSL 424.82■■□□□ 1.565e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-209ENST00000577707 534 ntTSL 424.49■■□□□ 1.515e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.55e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 MAST1-207ENST00000590883 1717 ntTSL 524.41■■□□□ 1.55e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-211ENST00000568731 484 ntTSL 324.12■■□□□ 1.455e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-232ENST00000584024 1965 ntTSL 224.11■■□□□ 1.455e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-212ENST00000577888 617 ntTSL 223.78■■□□□ 1.45e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.45e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-220ENST00000524210 2591 ntTSL 523.33■■□□□ 1.335e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-208ENST00000577594 481 ntTSL 222.5■■□□□ 1.195e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-219ENST00000606690 900 ntTSL 522.45■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 NECAB3-203ENST00000439478 925 ntTSL 522.45■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-210ENST00000420216 668 ntTSL 522.45■■□□□ 1.188e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM96B-203ENST00000563490 718 ntTSL 221.78■■□□□ 1.085e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-208ENST00000414893 528 ntTSL 321.61■■□□□ 1.058e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM60A-204ENST00000536836 1734 ntTSL 221.51■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM96B-204ENST00000567511 696 ntTSL 521.49■■□□□ 1.035e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.028e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CPEB1-202ENST00000566716 502 ntTSL 321.3■■□□□ 15e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.975e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CPEB1-201ENST00000563519 536 ntTSL 420.91■□□□□ 0.945e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-214ENST00000584080 584 ntTSL 420.62■□□□□ 0.895e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-209ENST00000417287 610 ntTSL 519.83■□□□□ 0.778e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-214ENST00000435719 817 ntTSL 319.79■□□□□ 0.768e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 BRF1-207ENST00000546417 554 ntTSL 319.67■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-234ENST00000584503 584 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.725e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.728e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.635e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TALDO1-204ENST00000530119 1191 ntTSL 218.64■□□□□ 0.576e-13■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.565e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-206ENST00000577436 1079 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-210ENST00000577732 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.555e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TNK2-214ENST00000464041 3545 ntTSL 1 (best)18.4■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.525e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 218.14■□□□□ 0.55e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.485e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-214ENST00000578895 3154 ntTSL 218■□□□□ 0.475e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-233ENST00000584408 497 ntTSL 417.64■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-207ENST00000414281 772 ntTSL 417.64■□□□□ 0.418e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-215ENST00000446031 273 ntTSL 317.59■□□□□ 0.418e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM60A-206ENST00000539409 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-204ENST00000372798 1563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.348e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-215ENST00000578913 563 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.265e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-203ENST00000360426 3211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.195e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM60A-201ENST00000337682 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-205ENST00000371802 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.175e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-211ENST00000577834 540 ntTSL 415.97■□□□□ 0.155e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.135e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-213ENST00000427843 739 ntTSL 515.75■□□□□ 0.118e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-202ENST00000372792 1496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.18e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-220ENST00000580560 564 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.025e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-201ENST00000340954 3334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-218ENST00000579444 470 ntTSL 214.78□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-237ENST00000585044 4327 ntTSL 214.74□□□□□ -0.055e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-202ENST00000347458 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-204ENST00000371792 3130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.075e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 C17orf62-236ENST00000584891 468 ntTSL 313.31□□□□□ -0.285e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-206ENST00000371828 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.35e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 STAU1-207ENST00000371856 3684 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 512.66□□□□□ -0.388e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.488e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 FAM96B-201ENST00000422424 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.625e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.658e-19■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 410.67□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PIP5K1C-207ENST00000636612 153 ntTSL 56.71□□□□□ -1.335e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 PPP1R37-207ENST00000544897 527 ntTSL 26.39□□□□□ -1.395e-7■■■■■ 29.7
DROSHAQ9NRR4 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 29.7
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