Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI1

IRX2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX2Q9BZI1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX2Q9BZI1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX2Q9BZI1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX2Q9BZI1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX2Q9BZI1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX2Q9BZI1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX2Q9BZI1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRX2Q9BZI1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRX2Q9BZI1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRX2Q9BZI1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms