Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PI4K2AQ9BTU6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PI4K2AQ9BTU6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PI4K2AQ9BTU6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PI4K2AQ9BTU6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms