Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK3

ZNF607, Zinc finger protein 607, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF607Q96SK3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZNF607Q96SK3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNF607Q96SK3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNF607Q96SK3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms