Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C9orf72Q96LT7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
C9orf72Q96LT7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.7 ms