Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MRPL53Q96EL3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MRPL53Q96EL3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms