Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SHISA4Q96DD7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SHISA4Q96DD7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SHISA4Q96DD7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms