Protein–RNA interactions for Protein: Q92949

FOXJ1, Forkhead box protein J1, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXJ1Q92949 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXJ1Q92949 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FOXJ1Q92949 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FOXJ1Q92949 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms