Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNX29Q8TEQ0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNX29Q8TEQ0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms