Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPFIBP2Q8ND30 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIBP2Q8ND30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIBP2Q8ND30 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms