Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ5

TRIM42, Tripartite motif-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM42Q8IWZ5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRIM42Q8IWZ5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRIM42Q8IWZ5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms