Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDB1Q86U70 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDB1Q86U70 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms