Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SV2AQ7L0J3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SV2AQ7L0J3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SV2AQ7L0J3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms