Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT79Q5XKE5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT79Q5XKE5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms