Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW7

C10orf55, Uncharacterized protein C10orf55, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55Q5SWW7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
C10orf55Q5SWW7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C10orf55Q5SWW7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C10orf55Q5SWW7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms