Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA2Q53GA4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA2Q53GA4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms