Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF3L2Q3SX64 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF3L2Q3SX64 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF3L2Q3SX64 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF3L2Q3SX64 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ODF3L2Q3SX64 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ODF3L2Q3SX64 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
ODF3L2Q3SX64 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ODF3L2Q3SX64 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms