Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMU1Q2TAY7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMU1Q2TAY7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms