Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB30Q15771 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB30Q15771 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB30Q15771 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
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