Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK3Q15120 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK3Q15120 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK3Q15120 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK3Q15120 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK3Q15120 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK3Q15120 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK3Q15120 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDK3Q15120 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDK3Q15120 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDK3Q15120 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PDK3Q15120 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms