Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 MYL6-211ENST00000548580 528 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.947e-9■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.287e-9■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 CTNNB1-215ENST00000488914 804 ntTSL 25.35□□□□□ -1.551e-9■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 NBR1-205ENST00000589872 3097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-7■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 NBR1-202ENST00000542611 2703 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 NBR1-206ENST00000590996 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.362e-7■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 NBR1-201ENST00000341165 4656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.872e-7■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 APEX1-209ENST00000555306 898 ntTSL 514.86□□□□□ -0.032e-8■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 223.02■■□□□ 1.283e-9■■■□□ 17.2
G3BP1Q13283 ABCF1-206ENST00000479542 893 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 LMO7-215ENST00000525107 536 ntTSL 53.45□□□□□ -1.866e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 RNF213-201ENST00000319921 5316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.023e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 HECTD1-208ENST00000554882 3748 ntTSL 56.13□□□□□ -1.433e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 HECTD1-210ENST00000555843 4281 ntTSL 25.76□□□□□ -1.493e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 NUMA1-218ENST00000540843 1969 ntTSL 215.04■□□□□ -02e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 NUMA1-212ENST00000536119 1686 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 NUMA1-207ENST00000534987 2211 ntTSL 212.76□□□□□ -0.372e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 ALDH7A1-206ENST00000476328 484 ntTSL 34.46□□□□□ -1.76e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.976e-8■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PDHA1-207ENST00000423505 731 ntTSL 222.26■■□□□ 1.154e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 14e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PDHA1-201ENST00000355808 699 ntTSL 318.89■□□□□ 0.614e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PDHA1-205ENST00000417819 471 ntTSL 318.89■□□□□ 0.614e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PDHA1-211ENST00000492364 611 ntTSL 216.28■□□□□ 0.24e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PPP2CA-202ENST00000472253 574 ntTSL 28.08□□□□□ -1.124e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 XPO1-219ENST00000481073 3706 ntTSL 23.39□□□□□ -1.875e-8■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 HADHB-203ENST00000412805 574 ntTSL 424.81■■□□□ 1.561e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PGD-207ENST00000491493 806 ntTSL 521.32■■□□□ 11e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 HSPA8-220ENST00000533238 465 ntTSL 37.9□□□□□ -1.143e-8■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 PGK1-205ENST00000491291 702 ntTSL 511.12□□□□□ -0.635e-13■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 QARS-231ENST00000634602 544 ntTSL 417.13■□□□□ 0.333e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 QARS-246ENST00000635622 701 ntTSL 314.24□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 EIF4G1-235ENST00000482303 493 ntTSL 217.21■□□□□ 0.351e-10■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 FLNB-208ENST00000475487 541 ntTSL 221.56■■□□□ 1.041e-8■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 FLNA-212ENST00000466319 460 ntTSL 220.85■□□□□ 0.932e-10■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 HSD17B4-223ENST00000518349 815 ntTSL 55.12□□□□□ -1.594e-7■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.932e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.092e-6■■■□□ 17.1
G3BP1Q13283 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.874e-11■■■□□ 17
G3BP1Q13283 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 AHSA1-206ENST00000555457 641 ntTSL 319.63■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 AHSA1-205ENST00000555133 1048 ntTSL 314.2□□□□□ -0.141e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-13■■■□□ 17
G3BP1Q13283 PSMB4-203ENST00000474100 755 ntTSL 58.96□□□□□ -0.981e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 UBA1-207ENST00000451702 1706 ntTSL 513.32□□□□□ -0.287e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.634e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 LAP3-209ENST00000513105 626 ntTSL 38.41□□□□□ -1.062e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.829e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.429e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 NME1-NME2-201ENST00000376392 894 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.159e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 AKAP1-217ENST00000576295 614 ntTSL 317.83■□□□□ 0.444e-10■■■□□ 17
G3BP1Q13283 TRAP1-215ENST00000576106 555 ntTSL 428.3■■■□□ 2.122e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 TRAP1-211ENST00000574941 558 ntTSL 424.35■■□□□ 1.492e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 TRAP1-206ENST00000571538 587 ntTSL 412.43□□□□□ -0.422e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 EIF3I-202ENST00000373586 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.063e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.842e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 CNDP2-229ENST00000585263 2566 nt18.74■□□□□ 0.591e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 PTCD3-201ENST00000254630 6734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.71e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.842e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 PTCD3-215ENST00000484203 928 ntTSL 27.59□□□□□ -1.191e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 PTCD3-213ENST00000480102 589 ntTSL 46.02□□□□□ -1.451e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 MATR3-226ENST00000515833 1001 ntTSL 54.69□□□□□ -1.661e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 HSPA9-205ENST00000505110 518 ntTSL 418.37■□□□□ 0.533e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 HSPA9-208ENST00000507115 663 ntTSL 312.06□□□□□ -0.483e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 HSPA9-203ENST00000504810 584 ntTSL 38.09□□□□□ -1.113e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 HNRNPU-224ENST00000640056 2045 ntTSL 511.74□□□□□ -0.532e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.072e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 HSPA8-215ENST00000532091 2301 ntTSL 512.74□□□□□ -0.372e-8■■■□□ 17
G3BP1Q13283 SEC13-219ENST00000492602 393 ntTSL 36.41□□□□□ -1.387e-12■■■□□ 17
G3BP1Q13283 SF3B2-201ENST00000322535 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 SF3B2-206ENST00000528302 3254 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.541e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 FLII-214ENST00000496727 792 ntTSL 520.75■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 17
G3BP1Q13283 CMTR1-201ENST00000373451 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-6■■■□□ 17
G3BP1Q13283 PRDX2-206ENST00000498785 505 ntTSL 212.04□□□□□ -0.487e-12■■■□□ 17
G3BP1Q13283 MTHFD1-210ENST00000555252 2053 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.931e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.761e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.551e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-206ENST00000398129 3787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.271e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ADD1-217ENST00000513328 3107 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 UTRN-203ENST00000367526 3220 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.612e-8■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 ATP5A1-208ENST00000589252 662 ntTSL 524.09■■□□□ 1.458e-10■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 FLNA-216ENST00000490936 5374 ntTSL 1 (best)19.38■□□□□ 0.693e-10■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-216ENST00000582260 743 ntTSL 520.68■□□□□ 0.96e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-212ENST00000581272 547 ntTSL 415.74■□□□□ 0.116e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-213ENST00000581513 568 ntTSL 315.74■□□□□ 0.116e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-219ENST00000582666 572 ntTSL 215.04■□□□□ -06e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-203ENST00000577355 536 ntTSL 315.04■□□□□ -06e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -06e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-221ENST00000583216 574 ntTSL 414.16□□□□□ -0.146e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 CNDP2-217ENST00000582589 539 ntTSL 513.6□□□□□ -0.236e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 LAP3-202ENST00000503467 1709 ntTSL 29.85□□□□□ -0.839e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 GCN1-202ENST00000547263 366 ntTSL 313.53□□□□□ -0.243e-8■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 DHX15-204ENST00000508032 3028 ntTSL 1 (best)4.68□□□□□ -1.663e-8■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 SEC23A-209ENST00000555363 704 ntTSL 26.2□□□□□ -1.424e-7■■■□□ 16.9
G3BP1Q13283 SEC23A-207ENST00000554615 3813 ntTSL 1 (best)4.01□□□□□ -1.774e-7■■■□□ 16.9
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