Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFX1Q12986 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFX1Q12986 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NFX1Q12986 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
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