Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
EMX2Q04743 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EMX2Q04743 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms