Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TFF2Q03403 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TFF2Q03403 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms