Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF135P52742 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF135P52742 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms