Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AMTP48728 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
AMTP48728 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AMTP48728 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AMTP48728 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AMTP48728 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AMTP48728 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AMTP48728 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AMTP48728 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms