Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA8P48165 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA8P48165 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA8P48165 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA8P48165 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA8P48165 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA8P48165 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA8P48165 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA8P48165 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA8P48165 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA8P48165 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA8P48165 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA8P48165 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA8P48165 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA8P48165 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA8P48165 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA8P48165 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA8P48165 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA8P48165 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJA8P48165 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA8P48165 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA8P48165 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA8P48165 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA8P48165 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA8P48165 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms