Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PCGF2P35227 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PCGF2P35227 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms