Protein–RNA interactions for Protein: P29590

PML, Protein PML, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMLP29590 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PMLP29590 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMLP29590 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMLP29590 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMLP29590 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMLP29590 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMLP29590 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PMLP29590 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PMLP29590 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PMLP29590 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMLP29590 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMLP29590 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMLP29590 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMLP29590 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMLP29590 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMLP29590 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PMLP29590 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PMLP29590 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMLP29590 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMLP29590 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMLP29590 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMLP29590 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMLP29590 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PMLP29590 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMLP29590 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMLP29590 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMLP29590 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PMLP29590 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMLP29590 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMLP29590 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PMLP29590 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PMLP29590 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMLP29590 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMLP29590 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMLP29590 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMLP29590 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMLP29590 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMLP29590 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PMLP29590 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PMLP29590 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PMLP29590 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PMLP29590 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMLP29590 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PMLP29590 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMLP29590 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMLP29590 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PMLP29590 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms