Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYN1P17600 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYN1P17600 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYN1P17600 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYN1P17600 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYN1P17600 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYN1P17600 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYN1P17600 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYN1P17600 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYN1P17600 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYN1P17600 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYN1P17600 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYN1P17600 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYN1P17600 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYN1P17600 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYN1P17600 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYN1P17600 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYN1P17600 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYN1P17600 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYN1P17600 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYN1P17600 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYN1P17600 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYN1P17600 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYN1P17600 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYN1P17600 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYN1P17600 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYN1P17600 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYN1P17600 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYN1P17600 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms