Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
COL6A2P12110 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COL6A2P12110 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms