Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
MARCH6O60337 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MARCH6O60337 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MARCH6O60337 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms