Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SYT7O43581 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SYT7O43581 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYT7O43581 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYT7O43581 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SYT7O43581 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SYT7O43581 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT7O43581 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT7O43581 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT7O43581 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT7O43581 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SYT7O43581 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SYT7O43581 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms