Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SUV39H1O43463 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUV39H1O43463 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms