Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN9O14815 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN9O14815 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms