Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
A0A0D9SFI3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
A0A0D9SFI3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
A0A0D9SFI3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms